当时只有土地出让金发票和土地手续正在完善中的部分证明?

您可能进一步想问的是：这些文件是否能作为土地权益的有效证明。从法律角度看，土地出让金发票是缴纳土地费用的凭证，而土地手续完善中的证明表明土地手续正在办理中，但两者单独或结合使用，可能并不足以完全证明土地权益的归属或完整性，因为完整的土地权益通常还需包括土地使用权证等法定文件。
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在不同情况下，为确保这些文件的法律效力，应尽快完善土地手续，取得土地使用权证等法定文件。同时，可通过律师见证、公证等方式增强文件的证明力。若涉及交易或诉讼，建议咨询专业律师，以法律手段保护自身权益。
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直接回复：需尽快完善手续。从法律角度看，不同情况下处理方式有：若土地手续可短期内完善，可等待并保留相关证据；若手续完善无望，可考虑通过法律途径主张权利或寻求赔偿。选择处理方式时，应综合考虑时间成本、法律风险等因素，并咨询专业律师意见。